A Maçonaria possui uma estrutura administrativa que permite o bom funcionamento da Instituição. É um espelho da organização do Estado Democrático de Direito, em que fazem parte os três poderes constituídos e harmônicos entre si : Executivo, Legislativo e Judiciário.

Como o Grande Oriente do Brasil é uma federação, sua divisão organizacional segue o formato federativo brasileiro, com os órgãos federais, estaduais e locais. Isso diferencia a Ordem Maçônica de muitas outras associações privadas e/ou públicas, pois tem regulamentação e funcionamento próprios e característicos da Instituição.

O Grande Oriente do Brasil é o Ente Executivo Federal. O Grande Oriente do Brasil – Paraná, nesse sentido, figura como o Executivo federado no estado.       As Lojas Maçônicas são órgãos da esfera municipal/local, sendo jurisdicionadas ao Grande Oriente do Brasil – Paraná e federadas ao Grande Oriente do Brasil.

A PAEL (Poderosa Assembleia Estadual Legislativa) é o Poder Legislativo responsável pela fiscalização dos atos do Poder Executivo Estadual e tem entre as suas atribuições a competência, através de proposta dos seus membros ou do Poder Executivo, elaborar as leis que regem a instituição no Estado. Ela é composta por Maçons eleitos pelas Lojas Maçônicas como seus representantes. Sua atuação está restrita ao ambiente maçônico do GOB-PR, sendo suas atividades restritas aos aspectos internos da Instituição.

A PAEL possui uma Mesa Diretora, cujos membros se ocupam de tarefas específicas para o funcionamento administrativo da Assembleia. O trabalho realizado pelos Deputados Estaduais Maçônicos é muito importante para a Maçonaria.